為使磁粉離合器能安全運行，加強冷卻散熱，提高允許滑差是非常重要的。磁粉離合器冷卻有自冷、強迫風冷及液冷等方式。自冷又分為只靠表面散熱和既靠表面散熱又在主動端加風扇進行自通風冷卻兩種。液冷分為水冷、油冷兩種。線圈旋轉式，旋轉外殼本身就相當于一個風扇，散熱能力較強，其散熱系數不僅與外殼散熱面積有關，而且與旋轉速度有關，不附加風扇的線圈靜止式自冷式離合器，其散熱系數僅與散熱面積有關。磁粉離合器的熱量散發，主要通過對流、輻射方式進。